1、堆藏：剛南瓜買回來後可以直接堆放在室內存放，堆放錢在地面上先鋪上一層細沙、麥秸或者是稻草，再在上面堆放南瓜，但是堆放的時候需要注意流出通道，以便後期檢查。南瓜擺放的方向是需要生長時的狀態相同，可以將瓜蒂朝裏，瓜頂向外逐個依次堆放成圓錐，每堆15-25個，高度5-6個瓜高為好，也可以裝筐堆藏，裝筐則不宜太滿，離筐口有1個瓜的距離即可。同時要注意前期儲藏外界温度會比較高，需要注意通風換氣，保持室內的新鮮乾燥，並且保持清涼，儲藏後期外界的温度比較低時，就需要開始防寒，温度最好是保存在0攝氏度以上。
2、架藏：架藏的倉位選擇、質量的挑選、降温、防寒防凍和通風等要求與堆藏的是一樣的，有不一樣的地方就是在倉庫內用木、竹或者鐵塔成分層儲藏架，鋪上草包，將南瓜堆在架子上，或者是用板條箱襯墊一層麥秸後，將南瓜疊放成一定形式進行儲藏。這種方式比較容易通風散熱，而且便於觀察檢查。
3、窖藏：窖藏的南瓜應該是選用主蔓上的第二個瓜最好，根瓜是不宜儲藏的。南瓜被採收後先將其放在24-27攝氏度下放置2周，使南瓜皮硬化，這樣有利於儲藏，而且在窖藏南瓜的時候要防止太陽暴曬，禁止滾動、拋擲，否則瓜瓤震動受傷易導致腐爛。
4、切開的南瓜保存：若是南瓜已經被切開了，則先需要將南瓜中的瓤挖出來，放入水中，不可水洗。然後用小勺子將鹽均勻的抹在了南瓜的切口上，或者是用紙巾將其包住南瓜切口處也可以，然後用保存保鮮膜將南瓜給包好，特別是切口處要包裹嚴實，不能漏氣，然後將南瓜放入冰箱冷藏室內就可以了，一般可以保存一個月左右。
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