1、首先從植物學分類上來説，藤椒屬於芸香科多年生灌木，又名竹葉花椒、萬花針、白總管、竹葉總管等。而花椒屬於芸香科、花椒屬落葉小喬木，屬類不同，但都屬芸香科。也就是説藤椒和花椒在植物學分類上來説，藤椒和花椒是不同屬的，藤椒是多年生灌木而花椒卻是小喬木。從枝莖來説，藤椒屬於小喬木，植株高度比花椒稍矮，枝葉較為緊湊、細小，枝幹刺多，枝幹延長形狀像藤蔓，故得名藤椒。而花椒樹非常高大，一般達5米左右，有的可能更高一些，這與生存的環境相關，樹幹常有不規則的分枝，嫩枝顏色綠色常有紅色的伴隨，老枝幹為深灰褐色，枝幹上有十分堅硬的刺。從花朵來説，藤椒花與花椒花都生於枝條的頂端，花椒的數量比較多大約有20-30片，呈綠色，花期在4-5月左右。
2、其次從果實來説，藤椒的果實幼時為綠色，有微凸起少數油點，果色為綠色，有光澤，含油多，結籽是像葡萄一樣呈串狀，果期8-10月左右，依種植地氣候土壤等因素有所不同。而花椒的果實在生長期顏色會發生變化，幼時為青綠色，成熟期為紫紅色，8-10月結果。而且藤椒在樹上結的籽是像葡萄一樣一串一串的，而花椒在樹上結的籽是一攥一攥的。
3、從味道上來説，藤椒幼時即可以食用，這一點與花椒不同，藤椒的香味比花椒清香，假如把花椒沒有成熟的放在嘴裏，口感特別苦澀，但是藤椒就沒有這種苦澀味，並且幼時藤椒還是主要的輔料。
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