1、使用山梨酸液保存法，可以將西瓜保存到冬天。具體步驟：選擇八成熟，表皮無傷無病蟲害的西瓜，在5%～10%的食鹽水中浸泡2～4小時，然後再用0.5%～1.0%的山梨酸鉀或山梨酸塗抹西瓜表面，密封在聚乙烯塑料袋內，按照西瓜在田間生長時的方位（即“瓜背”（原來向陽的一面）向上，“瓜肚”（原來接觸地面的部分）朝下）進行堆藏、筐藏、架藏。以架藏為佳，堆藏一般以三層為宜。存放期間勤翻堆檢查，及時撿出熟瓜和次瓜，清理病瓜、爛瓜可以從收瓜後的夏天一直存儲到冬天。另外保存貯藏場所適宜的温度是8～10℃，相對濕度為75%～80%，此時為西瓜最佳存儲條件。
2、架藏：在庫內設5～6層，寬80cm，長不定的固定架板，層間距約50cm，層離地面20cm，頂層距蒸發器風口35～40cm，架與架之間要留50～70cm人行道，架子最好要與內牆地面連接，保持堅固平穩。搭架完成後，要進行庫房及設施的消毒。辦法是，用庫房專用煙霧消毒劑或10～20克/m3碎食品加工用硫磺點燃密閉薰蒸24小時，打開庫門窗排出庫內殘留霧，然後在庫內撒一層消石灰以吸收多餘的二氧化碳，還可以起到吸濕的作用。
3、一切準備工作結束後，將運回的西瓜小心地擺放在架子上。注：在西瓜上架前要在架板上微鋪一層稻草秸，瓜與瓜之間留3cm的空隙，温度控制在8～10℃，相對濕度控制在75%～80%，無冷庫時，可利用地窖、山洞、人防工程等。但應注意不能過濕。此法可貯西瓜45～60天。瓜肉色澤鮮亮、味正。貯前若能用1000mg/L甲基託布津洗瓜，晾乾，貯藏效果更有保證。
4、褐藻酸鈉塗抹法。將褐藻酸鈉用温水溶解，稀釋為0.2%的濃度，用軟毛刷或者是軟布塗抹於西瓜表面，晾乾。存放在經過消毒處理的房間。為了充分利用空間，可以多層存儲。存放時，先在西瓜下面放一個經過陽光暴曬的草圈，按照瓜背”（原來向陽的一面）向上，“瓜肚”（原來接觸地面的部分）朝下的方式擺放。可以保鮮一個月左右。
5、瓜蔓侵出液塗抹法。用新鮮有機西瓜莖蔓研磨成的漿液噴塗有機西瓜，在普通房屋中貯藏，春節前上市，好瓜率達到80%。其做法是：採取新鮮的有機西瓜莖蔓，研磨成漿，將過濾後的原漿稀釋到300—500倍，噴灑在有機西瓜的果皮上，稍晾後立即用包裝紙包裝好，也可用牛皮紙或舊報紙包裝，放到涼爽通風的地方，注意存放西瓜處的環境濕度不應過大，否則容易使包裝紙發黴並造成爛瓜。其原理是：因為西瓜的莖蔓中含有抑制果實後熟的物質，被西瓜吸收後能起到防止後熟衰老的作用。貯存過程中，每隔7—10天應翻整檢查一次，揀出不宜繼續貯存的個體。翻整中應注意兩點，一是不要改變西瓜擺放的方位。因改變方位會改變重力作用的方向，而縮短保鮮時間。二是不要弄破包裝紙。包裝紙在貯存中可以起到緩衝濕度變化、隔絕細菌傳播、減少相互摩擦的作用。
6、存儲前的準備。
7、選瓜。選擇瓜皮堅韌、不容易崩裂、品質優良、抗病性強的西瓜，採前一週停止澆水，在七成半成熟時採摘（熟透的有機西瓜不易貯藏），採摘時應帶消毒手套，並在果實上保留10釐米以上的瓜蔓。
8、預冷。西瓜成熟季節温度較高，在運輸或入庫保存前，使西瓜的體温儘快下降，有利於保持有機西瓜的品質。自然降温是利用清晨氣温最低時從田間地頭裝車運輸。有條件的也可利用冷風機等機械方法冷卻。
9、消毒。西瓜保鮮貯藏的方法很多，無論用什麼方法都要對貯藏場所和有機西瓜表面進行消毒處理。常用消毒液有：40%福爾馬林150-200倍溶液、15%-20%食鹽水溶液、0.5%-1%的漂白粉溶液、倍量式波爾多液、0.1ml/kg的菌多零。
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