1、定義不同。蜂巢蜜是蜜蜂完全釀製成熟並封蓋的蜜脾，蜂巢蜜，又稱格子蜜。利用蜜蜂的生物學特性，在規格化的蜂巢中，釀造出來的連巢帶蜜的蜂蜜塊、巢蜜既具有分離蜜的功效，又具有蜂巢的特性，是一種被譽為最完美、最高檔的天然蜂蜜產品。普通蜂蜜，也就是分離蜜，又叫做分離心蜜或壓榨蜜。是把蜂巢中的蜜牌取出，置在搖蜜機中，通過離心力的作用搖出，並經過濾的蜂蜜，或用壓榨巢脾方法從蜜牌中分離出來並過濾的蜂蜜。這種新鮮的蜜一般處於透明的液體狀態，有些分離蜜經過一段時間就會結晶。蜂巢蜜和普通蜂蜜最大的區別是成熟度不同。
2、外觀不同。蜂蜜是由成熟蜂蜜和巢脾組成的，因此整體看起來就像一塊巢脾，但並不完全是固體狀，顏色與蜜種有關，而普通蜂蜜也叫分離蜜，是從蜜脾中壓榨分離出來的蜂蜜，外觀呈粘稠的液體狀且不同的蜜種有不同的顏色，事實上從外觀來看非常容易區別蜂巢蜜和普通蜂蜜，只需要看帶不帶巢脾即可。
3、成分不同。蜂巢蜜幾乎是所有蜂產品的綜合體，主要成分是蜂蜜和蜂蠟，尚含少量的蜂王漿、蜂膠、蜂花粉及蜂繭衣等成分，而普通蜂蜜則只含蜂蜜和少量的蜂花粉，因此從營養成分的種類上來説蜂巢蜜要豐富和全面得多，另外蜂巢蜜含有大量的活性酶，而普通蜂蜜基本上沒有活性酶(高温濃縮會導致酶類失活)。蜂巢蜜是更接近天然的原始蜂蜜！
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