1、普通凍藏法：若需要進行冷藏的菠菜一般是夜晚地面上凍，中午又能化凍時採收。採收時帶約1.6釐米長的根，清除泥土，整理捆把，每捆2公斤左右，放在陰涼處倒掉露水，待天氣轉冷時凍藏。貯藏場地應選在遮陰處，整平地面，挖寬深各35釐米的溝，溝間距5～10釐米，將菠菜根朝下襬放入溝，總厚度為25釐米左右。到嚴寒季節可在上面再加草苫子等，保持溝內温度為-8℃至-5℃。
2、通風溝凍藏法：為克服普通凍藏法不能調節温度的缺陷，可採用通風溝凍藏法。溝寬1.5米，深0.5米，順溝底挖兩條寬25釐米左右的通風道，通風道兩頭相通，通風用架杆橫鋪一層，將菠菜捆擺在架杆上，覆土與普通凍藏相同。天暖時利用通風道交換外界冷空氣，天氣轉冷後用草把堵塞通風道，開春天氣轉暖後再逐漸打開。
3、暖貯藏法：挖寬75釐米、深60釐米的溝，立冬至小雪間起菜，隨即將菠菜根朝下襬放溝內，蓋上一層甘蘭葉，溝頂蓋草苫。之後隨天氣變冷蓋草苫，使溝內保持0℃～2℃。
4、地上凍藏法：在收穫前5～6天，把菠菜場地整平，潑一層水，以保證有土不解凍為宜。貯菜時，先撒些菜葉或樹葉鋪底，然後把菠菜一捆挨一捆地擺在上面，再在菜的四周用菜葉或枝葉蓋好，約有10～12釐米即可。當菠菜內部凍結時，再在上面蓋10釐米厚的半乾濕沙子，以防葉子失水過多，造成損失。
5、合畦凍藏法：選好菠菜生長健壯的地塊及合畦凍藏組合，每個組合三畦，其中左一畦和右一畦為起菜畦，中間一畦為凍藏畦。凍藏前，先用鐵撳把凍藏畦菠菜全剷斷根系，其深度以入土1.5釐米為宜，全鏟時不要弄亂菜株。同種方法，把左右兩畦的菠菜剷起，扣蓋在中間的凍藏畦上，葉部朝下，根部向上，3個畦子的菠菜合成1畦，貯藏當天，將後畦表面用土埋嚴，輕拍，使菠菜上下層之間密合，防止寒風進入，氣温過低時，再蓋一層7～10釐米厚的細土，利用此法可貯到翌年春分。
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