1、催芽：番茄經過催芽之後再進行育苗，有利於苗齊苗壯。先將種子用30℃左右的温水浸泡三四個小時，等種子吸水膨脹後，撈出，放到白色紗布中，去掉上面漂起來的癟種子。用白紗布裹好之後，放到25~28℃的環境下進行催芽。如果沒有恆温箱，可以放到熱水袋上，然後外面蓋上一個稍微濕一點的毛巾，外面的温度儘量保持到28℃左右。一般48小時之後就能露白了，等到70%左右的種子出芽之後就可以進行播種了。
2、選擇營養缽：育苗的方式有穴盤育苗，營養缽育苗以及泥炭育苗。營養缽的規格有很多，有口徑8釐米，10釐米，13釐米的，一般番茄育苗需要20多天，可用口徑8釐米的營養缽。然後將營養土倒入營養缽內，依次排開，每個裏面放入2~3粒發芽的種子。
3、苗期管理：在番茄苗長出2~3片真葉前進行分苗，移到穴盤中。以後的4~5天，白天的温度不高於33℃，夜晚温度不低於13℃。白天温度超過33℃，要在中午前後短期放風。
4、番茄苗期的管理非常重要，主要發生的病害有猝倒病，立枯病，早疫病，要及時防治。在出苗後，保持土壤濕潤，不能太乾，每天要噴一次透水。等到出苗5天之後，用螯合鈣2克，農用鏈黴素4克，再加入30斤水進行噴霧。等到4~5天之後，用磷酸二氫鉀5克，螯合硼2克，惡黴靈3克，進行噴霧。再過5天之後，用螯合鈣5克，螯合硼2克，再加上咯菌清4克，進行噴霧。
5、幼苗長出4~5片真葉時，容易徒長，對於已經旺長的番茄苗，可用50毫克/千克的矮壯素噴灑。苗期大概有20多天，在移栽之前，可用微生物菌劑起苗，再移栽。
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