1、研究內容不同：化學是研究在分子、原子層次上研究物質的組成、性質、結構與變化規律，從而創造新物質的科學。物理學是研究物質運動最一般規律和物質基本結構的學科。是關於大自然規律的知識；更廣義地説，物理學探索分析大自然所發生的現象，以瞭解其規則。
2、學科分類不同：物理學分為牛頓力學與分析力學研究物體機械運動的基本規律及關於時空相對性的規律、電磁學與電動力學研究電磁現象、物質的電磁運動規律及電磁輻射等規律、熱力學與統計力學研究物質熱運動的統計規律及其宏觀表現、狹義相對論研究物體的高速運動效應以及相關的動力學規律、廣義相對論研究在大質量物體附近、物體在強引力場下的動力學行為、量子力學研究微觀物質運動現象以及基本運動規律。此外還有粒子物理學、原子核物理學、原子與分子物理學、固體物理學、凝聚態物理學、激光物理學、等離子體物理學、地球物理學、生物物理學、天體物理學等等。化學分為無機化學、有機化學、物理化學、分析化學、高分子化學、核化學、生物化學。其它與化學有關的邊緣學科還有地球化學、海洋化學、大氣化學、環境化學、宇宙化學、星際化學等。
3、性質不同：物理學是人們對無生命自然界中物質的轉變的知識做出規律性的總結。這種運動和轉變應有兩種，一是早期人們通過感官視覺的延伸，二是近代人們通過發明創造供觀察測量用的科學儀器，實驗得出的結果，間接認識物質內部組成建立在的基礎上。化學是物質在化學變化中表現出來的性質，如所屬物質類別的化學通性，有酸性、鹼性、氧化性、還原性、熱穩定性及一些其它特性。
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