1、外形的區別
鮑魚：其外殼是單個的，且質地比較堅硬，殼型方向是右旋的，表面的顏色為深綠褐色。殼的內側分佈着紫、綠、白等色。貝殼的形狀像耳朵，殼的背側突起一排穿過的孔，軟體部分的肉是橢圓形的，寬大而扁平，呈黃白色，大的看起來像茶碗，小的則跟銅錢相似。
生蠔：其外殼是兩殼形狀的，表面粗糙，顏色為暗灰色，上部分殼中間部分會有隆起，下部分殼附着於其他物體上，兩殼的裏面白色光滑，中間部分有強大的閉殼肌。若有一粒外物跑到生蠔的殼內，生蠔則會分泌珍珠質將外物包裹起來變成珍珠，這也是常常吃生蠔的人會吃到珍珠的原因。
2、生存環境的區別
鮑魚：其對水質要求比較高，需要淨化過的海水才能養殖，一般鮑魚喜歡生活在海水清澈、海藻叢生的巖礁海域，以吃海藻和浮游生物為生。
生蠔：其生活在深淺不一的海水或有鹽味的河水領域中，附着在淺海物體或海邊礁石中，以浮游動物、硅藻、有機碎屑等為食。
3、營養價值的區別
鮑魚：其含有“鮑靈素”，能提高免疫力，破壞癌細胞。鮑魚的殼被中醫稱為“石決明”，有明目退翳、清熱平肝的作用。
生蠔：其含有牛磺酸，有保肝利膽的作用。生蠔提取物能夠抑制血小板聚集，降低血脂有利於胰島素的分泌。
4、功效的區別
鮑魚：其更適合女性食用，有滋陰美顏、補血益氣、治療女性月經不調等功效。
生蠔：其更適合男性食用，有壯陽造血、補鋅、降低膽固醇、預防心肌梗塞的功效。
5、食用禁忌的區別
鮑魚：其不能和雞肉、野豬肉、牛肝同食，否則會影響消化吸收。
生蠔：其不能和包菜一起食用，否則影響鈣和鋅的吸收。
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