1. 酵母菌:廣泛應用於麪包、啤酒、葡萄酒等食品和飲料的發酵。
2. 乳酸菌:常用於酸奶、奶酪、發酵蔬菜等食品的製作,也用於某些藥物和保健品的生產。
3. 醋酸菌:用於食醋的製作,也有一定的應用於藥物和有機化工產品的生產。
4. 嗜熱菌:被廣泛應用於食品加工和醫藥工業。常用於產生食源性菌毒素的有毒菌株的殺滅。
5. 微生物羣:是指在食品發酵中常見的一組菌種,包括乳酸桿菌、酵母菌和酪酸芽孢桿菌等,是很多發酵食品中的重要菌羣。
6. 麴黴菌:廣泛應用於豆腐、汾酒、醬油、味噌等食品的發酵,也用於生產橙色素、蜜環素等工業產品。