1、1986年袁隆平提出了雜交水稻的育種戰略，將雜交水稻的育種從選育方法上分為三系法、兩系法和一系法三個戰略發展階段，即育種程序朝着由繁至簡而效率越來越高的方向發展。
2、從雜種優勢水平的利用上分為品種間、亞種間和遠緣雜種優勢的利用三個戰略發展階段，即優勢利用朝着越來越強的方向發展。
3、根據這一設想，雜交水稻每進入一個新階段都是一次新突破，都將把水稻產量推向一個更高的水平。這項戰略構想的提出，為中國已取得三系法雜交水稻研究、開發成功後開展雜交水稻新探索指明瞭方向。
4、1987年7月16日，袁隆平學生李必湖、鄧華風，在安江農校秈稻三系育種材料中，找到一株光敏不育水稻。歷經兩年三代異地繁殖和觀察，該材料農藝性狀整齊一致，不育株率和不育度都達到了100%，並且育 性轉換明顯和同步。
5、這一新成果，為雜交水稻從“三系法”過渡到“兩系法”開拓了新局面。同年他提出“雜交水稻的發展戰略”，即三系法為主的器種間雜種優勢利用；兩系法為主的秈粳亞種雜種優勢利用；一系法為主的遠緣雜種優勢利用。
6、1987年，國家“863”計劃將兩系法雜交水稻研究立為專題，袁隆平組成了兩系法雜交水稻研究協作組開展全國性的協作攻關。歷經九年的艱苦攻關，1995年兩系法雜交水稻取得了成功，一般比同熟期的三系雜交稻增產5%～10%，且米質一般都較好，近年的種植面積為6000畝左右。
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