1、按照植物進化和分類系統排列布局的分區，稱為植物進化系統專類區，或稱系統園、樹木園等。該專類園以植物分類學為理論基礎，依據一定的分類系統，將植物按照進化順序排列布置，反映了植物界由低級到高級發展進化的過程。它可以任何等級上的一個分類單位為基礎，如一個綱、目、科、屬或種。目前運用較多的分類系統有Engler(恩格勒)系統、Hutchinson(哈欽鬆)系統、Cronqust(克朗奎斯特)系統、Hutchinson(哈欽鬆)系統、Takhtajan(塔赫他間)系統等。
2、按照植物地理來源佈置的專類區以植物地理學為基礎。收集來自世界各地某些地區的植物。該專類區，往往是要展示具有特別趣味的植物類型及其原產地和分佈情況，比如澳大利亞的山龍眼科植物、馬達加斯加島的棕櫚科植物、熱帶美洲的附生鳳梨科植物、西南歐的球根植物等。按照植物地理來源或以植物區系佈局的專類園，可以增進人們對世界各地植物種類、植被類型及所依附的自然地理條件的認識，加深對世界各地植物資源的瞭解。
3、按照植被類型佈局，所謂植被類型，即在不同的地理環境和不同的氣候條件下，根據植物與植物、植物與環境之間的.相互關係所形成的不同的植物羣落。大多植被類型專類區，是為了保護展示當地本土植物而建立的，目的是指導重建和恢復真正的自然生境，具有一定的科學意義。例如，古巴哈瓦那國家植物園的蛇紋巖地區植被;我國吉林長春森林植物園的長白山地區植被，西雙版納熱帶植被，湖南南嶽植物園的低丘陵植被等。
4、按照植物生長所處生境佈局該專類區，通過運用適合在同一生境下生長的植物造景，來表現此生境特有的植物景觀。表現的主體是植物，表現主題則是不同類型的生境。根據植物對其主要影響環境因子要求的不同，形成了多樣的專類園。其中，根據植物對水分的不同適應性，可分為水生植物區、濕生植物區、中生植物區、旱生植物區;根據植物對不同土壤的要求，有巖石園、鹽生園、沙漠植物區、沙旱生植物區等;根據光照和温度條件的不同，有陰生植物區、高山植物區等。
5、按照親緣關係相近原則佈局，將親緣關係相近的植物，如同科或亞科、同屬、同種作為分類標準，進行佈局而組成的植物專類區。其中同種植物專類區，是由該種植物的不同品種及變種組成。這類專類區(園)的主題植物在花期常有較高的觀賞價值，如梅園、菊圃、牡丹園、月季園、荷園、櫻花園、桂花園等。植物園中同種植物專類區的數量相對較少，多半會引入其他親緣關係相近的種，組成同屬植物專類區。
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