1、清沿襲明制，大致分省、府、縣三級，總督、巡撫為掌握行政、軍事、監察大權的高級地方官員，佈政、按察兩使為督、撫的屬官。與督、撫平行的有駐防將軍和提督學政，不過駐防將軍只管八旗駐軍；提督學政只管學校與科舉考試，其權力不能與督、撫相比的。
2、省以下有道的設置，道為監察區性質，不算正式行政區。道主要有分守道和分巡道兩種，兼兵備銜，另有一些不屬佈政、按察二司的道，如海關道、管河道、督糧道、鹽法道等。省以下為府，設知府、同知、通判等官，與府平行的有直隸廳，設同知、通判。
3、府以下為縣，設知縣、縣丞、主簿等官，與縣平行的為散廳，設置同直隸廳。在少數民族地區則設專門機構管理，即土司，一般分為兩種：一種由軍事部門管轄，如宣慰司、宣撫司、安撫司、招討司、長官司等，其中還有投降清朝的土司官職由明朝直接承襲下來的指揮使司，長官為指揮使，宣慰使、宣撫使、安撫使等。
4、另一種是由行政部門管轄，也設府、縣等，官員稱土知府、土知縣，通常由少數民族頭人擔任。
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