1、登錄：企業通過工商網站進入網上年檢平台，選擇登錄方式。方式一：企業無營業執照電子副本的，輸入企業營業執照上的企業標識和企業名稱，網上年檢系統（以下簡稱系統）顯示企業名稱和註冊號，企業確認後登錄用户界面。方式二：企業持有工商部門頒發的營業執照電子副本的，將其插入電腦USB接口並輸入密碼。系統自動匹配，確認企業身份，企業登錄用户界面。
2、填寫年檢報告書：企業登錄用户界面後點擊“填寫年檢報告書”按鈕。系統將根據登錄企業的類型自動匹配相應的年檢報告書。企業在網上填寫年檢報告書的過程中，可點擊“暫存”按鈕暫時保存所填寫的內容，並可重複登錄，對錯漏的內容進行補充修改，直至確認所有填寫內容準確完整。
3、申報：企業確認填寫內容準確完整後點擊“提交”按鈕。系統將根據網上年檢報告書中設置的必輸項和表間平衡進行判斷和計算，不符合要求的，自動提示企業進行補充修改；符合要求的，將提示企業申報結果。
4、預審：工商部門在企業申報網上年檢後5個工作日內對其申報內容進行預審。工商部門認為企業申報內容不完整或者有錯誤的，網上告知預審結果，並退回企業修改；認為企業申報內容完整且符合年檢規定的，網上告知其預審結果；認為企業涉嫌違反工商行政管理法律、法規或者規章的，網上告知預審結果，並要求企業在規定時間內到指定工商年檢窗口辦理年檢相關事宜。預審結果查詢：企業登錄網上年檢用户界面，查詢預審信息。查詢結果為“退回修改”的，點擊“修改年檢報告書”按鈕，根據工商部門退回修改的意見對網上年檢報告書內容作補充修改。查詢結果為“查看預審結果”的，根據告知書要求下載打印經預審的年檢報告書，攜帶告知書所列材料，在規定時間內到指定地點辦理年檢相關事宜。
5、複核：企業攜帶經預審的年檢報告書和相關年檢材料到指定地點辦理年檢覆核。
6、年檢付費和年檢戳記加蓋：企業繳納工商年檢費後，工商部門在企業營業執照正、副本（原件）上加蓋年檢戳記。部門依法對其申報材料進行審查。
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